選択手順
ドラフト前に自由獲得選手を2名まで獲得可能とし、
- 2名獲得の球団は1巡目、2巡目、3巡目の選択を外れる。
千葉ロッテ、ヤクルト、読売、阪神、横浜 - 1名獲得の球団は1巡目、3巡目の選択を外れる。
オリックス、東北楽天、中日 - 自由獲得なしの球団は2巡目の選択を外れる。
西武、福岡ダイエー、北海道日本ハム、広島東洋
ウエイバー順（今年度の成績下位球団順）
横浜 → オリックス → 広島東洋 → 千葉ロッテ → 阪神 → 北海道日本ハム → 読売 → 福岡ダイエー → ヤクルト → 中日 → 西武 → 東北楽天
1巡目 （自由獲得なしの球団が参加）
選択を希望する選手名を用紙に記入し全球団同時に提出する。指名が重複した場合は抽選で決定する。抽選はウエイバー順で行う。
（ 広 → 日 → ダ → 西 ）
抽選に外れた球団は再度用紙を提出し、1巡目に参加するすべての球団の指名選手が決定するまでこれを繰り返す。
2巡目 （自由獲得1名の球団が参加）
ウエイバー順で指名を行う。
オ → 中 → 楽
3巡目 （自由獲得なしの球団が参加）
ウエイバー順で指名を行う。
広 → 日 → ダ → 西
4巡目以降 （全球団が参加）
4巡目は今年度の成績順で指名を行う。5巡目はウエイバー順で指名を行う。以降、交互にこれを繰り返す。
▽4巡目、6巡目、8巡目・・・
楽 → 西 → 中 → ヤ → ダ → 巨 → 日 → 神 → ロ → 広 → オ → 横
▽5巡目、7巡目、9巡目・・・
横 → オ → 広 → ロ → 神 → 日 → 巨 → ダ → ヤ → 中 → 西 → 楽
- 全球団が選択終了するか、自由獲得選手を含め120名に達したところで終了。
（本年度は自由獲得選手13名のため、指名選手人数は107名まで）